百日咳治療不及時導致病情加重，有可能出現支氣管肺炎、肺不張、肺氣腫、百日咳腦病等後遺症，嚴重時有致命風險。
1、支氣管肺炎
百日咳病情加重，有可能誘發支氣管肺炎，出現發燒、咳嗽、氣短、憋喘等不適症狀，嚴重時還會影響到神經系統。
2、肺不張
百日咳病情加重，反覆咳嗽可能導致多個肺段或肺葉中含氣量減少，出現肺不張，嚴重影響呼吸系統功能。
3、肺氣腫
反覆的咳嗽導致終末細支氣管遠端氣道的彈性減退、過度膨脹等，會誘發肺氣腫。
4、百日咳腦病
反覆咳嗽會讓腦部缺氧、充血、水腫，這時就可能引發百日咳腦病。
