口腔粘膜柔軟，血管豐富，唾液分泌量少，有利於微生物的繁殖，引起口腔感染。
新生兒期最常見的口腔感染是白色念珠菌感染，俗稱鵝口瘡。主要是因爲母親的乳頭和哺乳者的手部污染。口腔粘膜出現點狀或小白膜，不易擦拭，無疼痛，不影響哺乳。
但抵抗力低下時，病變擴散到喉嚨、食管、氣管、肺等，引起嚴重感染。得了鵝肝後，必須儘快去醫院治療。
鵝口瘡可預防。母乳餵養時，要保持乳房和乳頭的清潔，哺乳結束時，可以擠出少量的乳汁，塗在乳暈部，自然乾燥。
乳汁具有抑菌作用，可避免感染。人工飼養時，每次使用奶瓶和奶頭都要清洗乾淨，煮沸消毒。其他哺乳用品，如小毛巾等應與成人分離，每次使用後煮沸消毒，曬乾。平時大人在哺乳前或接觸嬰兒前，要注意洗手，以預防爲主。
新生兒口腔上齶中間和牙齦上出現黃色小粒子和黃色小結節，主要是由於上皮細胞的堆積，通稱爲馬牙和鼓氏珠。這都是生理現象，千萬不要用棉籤擦或用針挑破。一般幾周後會自行消失。
