嬰兒各器官功能不成熟，易損壞，四種藥物必須謹慎使用或禁用。
第一，氨基糖苷。衛生部明確規定6歲以下兒童禁止使用此類藥物。例如，慶大黴素、丁胺卡那黴素和鏈黴素可導致耳聾和腎衰竭；
二是大環內脂類。紅黴素、羅紅黴素、阿其黴素這些治療衣原體、軍團菌、支原體的特效藥，往往對肝臟損傷大，用藥劑量大、用藥時間長，可能造成肝功能衰竭、藥物性肝炎，甚至死亡;
第三，氯黴素。這種藥物現在很少臨牀使用。嬰兒使用這種藥物可能會導致再生障礙性貧血和灰嬰綜合徵，嚴重衰竭肝功能；
第四，奎諾酮類藥物。建議成人普及的氟諾沙星、環丙沙星等藥物基本不使用或謹慎使用。現有實驗數據顯示，這些藥物會導致軟骨發育障礙，影響嬰兒的生長髮育。
