癲癇對高級神經機能損害作用較大，尤其可致智力障礙。據國內一份流行病學調查資料，在85170名0～14歲的兒童中，共查出癲癇患兒294例，患病率爲3.45%，其中智力低下者99例，佔33.7%。由此說明，在癲癇兒童中，智力低下的發病率是比較高的。
癲癇兒童的智力低下，主要取決於腦損害程度，而引起癲癇兒童智力低下的重要原因是其原發病。癲癇兒童的認知障礙還與癲癇類型、發作頻率與病程、腦電圖及抗癲癇藥物有關。癲癇的類型及影響癲癇兒童智力因素主要有：繼發性癲癇，如各種腦炎、產傷，或患有先天性遺傳病等，幾乎均可導致智力障礙；原發性癲癇，大約有1/3可出現智力障礙。據文獻報道，癲癇兒童認知障礙也和癲癇類型有關，其中小運動型發作伴智力低下的百分比最高，達59.3%；失神小運動發作最低，佔10%。
文獻報告癲癇患兒嚴重認知功能損害大都由多種藥物所致，因此，在癲癇治療中，對於選擇藥物品種要權衡利弊，既要達到較好的治療效果，又要盡要能地減少藥物對患兒智力影響程度，並提倡單藥治療。
最後需要指出的是，目前臨牀上還沒有根治癲癇的方法，因此，還不能完全防止智力發育的因素均有了一定了解，可以通過控制有關損害因素，儘可能減少智力障礙出現，如開展遺傳諮詢，做好產前及孕期保健，減少先天遺傳病的發生。對於已經確診的患兒，及早合理規律治療，力爭在短期內控制發作，從而大大減少智力低下發生的可能性。
癲癇發作如果本身很短暫，並且用藥物有效控制，不會影響小兒智力。但是一旦癲癇反覆發作，特別是出現持續狀態，腦部持續缺氧，神經元破壞增多，這樣就可能影響智力。有一些孩子變傻並不是治療藥物造成的，都是由於癲癇持續造成的。目前發現，按照國內外統一標準，小兒癲癇患者在接受手術並在術後有效控制病情，其智商普遍比術前提高。
