慢性細菌性前列腺炎是由一種或數種病原菌引起的前列腺的慢性細菌感染，進行抗菌治療是非常重要的，以下爲抗菌藥物治療的注意事項：
1、對於發作期間有症狀的患者用藥可以長達12周，對於發作期間無症狀的患者一般6周左右就可以了。對於反覆發作的患者，應進行預防性治療。
2、對於慢性非細菌性前列腺炎的患者，由於可能感染某些難以培養或鑑別的病原體，給予2～4周的抗生素治療。如果症狀改善，則可以再應用2～4周。
3、如抗生素治療效果不明顯，則需要重新調整治療方案。
4、應用抗生素治療慢性非細菌性前列腺炎療程一般不超過8周，長時間應用抗生素不僅不能夠殺滅耐藥的殘存病原體，還可能導致菌羣失調甚至二重感染。
5、首選的抗感染藥物是三代喹諾酮類藥物，如左旋氧氟沙星、諾氟沙星、依諾沙星等。也常使用大環內酯類藥物，如用紅黴素、阿齊黴素、米諾環素、克拉黴素等。
6、慢性前列腺炎的患者單純應用抗感染治療不一定能取得明顯的效果，抗生素往往需要聯合應用其他藥物來發揮治療作用。
