男性嬰兒比女性嬰兒多，以發病為主，沒有明顯的季節性，出生後胎糞正常，出生後2~3周內發病，以2~10天為高峯，新生兒腹瀉流行時NEC也時沒有性別，年齡和季節的差異。
1、腹脹和腸鳴聲減弱:患兒首先胃排空延遲，胃滯留，然後腹脹，輕者只有腹脹，嚴重病例症狀迅速惡化，腹脹如鼓，腸鳴聲減弱，甚至消失，早產兒NEC腹脹不典型，腹脹和腸鳴聲減弱是NEC早期出現的症狀，高危患兒應隨時觀察腹脹和腸鳴聲次數的變化。
2、嘔吐：患兒常出現嘔吐，嘔吐物可呈咖啡樣或帶膽汁，部分患兒無嘔吐，但胃內可抽出含咖啡或膽汁樣胃內容物。
3、腹瀉和血便:最初是水樣便，每天5~6次到10次以上，1~2天后是血樣便，可以是血、果醬或黑便，有些病例沒有腹瀉和肉眼血便，只有大便隱藏血液陽性。
4、全身症狀:NEC兒童反應差，神萎，拒絕食物，嚴重病例顏色蒼白或青灰，四肢發冷，休克，酸中毒，黃疸惡化，早產兒反覆呼吸容易停止，心律緩慢，體温正常或低熱
