一般來說在臨牀上，這兩種藥物是可以在一天內服用的，但是服藥順序有先有後，如果患者確實有相應的症狀，是可以在醫師指導下，服用這兩種藥物的。
建議患者先口服蒙脫石散或者是飯前，或者是空腹進行服用，然後在應用藿香正氣水口服，因爲，蒙脫石散可以吸附一些其他藥物的有效成分，導致其他藥物的有效成分，不能完全釋放出來，從而可能會在一定程度上影響其它藥物的有效成分的發揮。
另外，如果患者應用這兩種藥物，建議患者應當至少間隔一到兩個小時左右，如果患者應用這兩種藥物，腹瀉仍然不能夠得到緩解，需要去正規綜合性醫院就診，建議在醫師指導下完善一些相關化驗檢查，必要時需要進行補液或者是應用一些抗菌藥物，或者是活性菌製劑來進行治療。
