1、消化系統不成熟：嬰幼兒消化系統發育不成熟，酶的活性較差，但營養需要相對又高，腸道負擔重。如果餵養不當，如過多地加喂澱粉類、脂肪類食物，導致成分改變，或者一次進食過多等，都可引起消化功能的紊亂，導致腹瀉。
2、免疫功能不成熟：嬰幼兒時期的神經系統、內分泌系統、循環系統以及肝、腎功能均未成熟，調節機能較差，免疫功能也不夠成熟，當有病原菌隨受污染的食物進入體內後，易造成腹瀉。
3、輪狀病毒感染：嬰兒秋冬季腹瀉主要由於輪狀病毒感染所引起(致病微生物可隨污染的食物或水進入寶寶消化道)，這種情況多發生於人工餵養兒，餵養時所用的器皿或食物如不經過消毒或消毒不佳，即有感染的可能。病毒也可通過呼吸道或水源感染，這種情況多發生在8—12月，以10—11月份爲最高峯。
4、溫差大：秋冬季氣溫變化大，忽冷忽熱。氣候變化引起感冒、腹部受涼以及各種感染也可導致腹瀉。
一、臨牀表現：
蛋花湯樣大便較具特徵性。發熱較常見，病初嘔吐也多見。有一部分小兒，可先出現發熱和嘔吐，如未出現腹瀉症狀而就診的話，較易誤診。而在嘔吐消失後不久出現蛋花湯樣腹瀉，此時才恍然大悟：秋季腹瀉。對於有這樣發展過程的腹瀉病，不用懷疑，肯定是秋季腹瀉。
二、鑑別診斷：
並不是秋季的腹瀉都是輪狀病毒感染。經常診治秋季腹瀉，不要被經驗和習慣矇蔽了眼睛。秋季腹瀉仍是需要與其他一些有腹症狀的疾病相鑑別的。
1、嬰糼兒急疹：多見於1歲以下的小兒，6個月以下的小兒更多見，皮疹出現前常有發熱，有些伴有腹瀉，但這種腹瀉經過治療易緩解，皮疹出現後，腹瀉症狀和發熱一樣，也消失了。
2、胃腸型感冒：多見於挑食的小兒，這樣的小兒看上去就是有點消瘦，舌苔也常有地圖舌和花剝苔，如果仔細問病史，家長會告訴您，以前發熱感冒都會嘔吐和腹瀉，胃腸型感冒，以嘔吐症狀較常見，腹瀉較輕，常不被重視。
3、細菌性腸炎：尤其是侵襲性腸炎早期，在膿血便出現之前，可以僅有嘔吐或稀便，有些有輕度發熱，此時就診，極易誤診，常是治療後不久家長又來找您了：小孩又發熱了，拉膿血便了，有腹痛了。總的來說：鑑別診斷也有取巧的辦法：對於鑑別細菌性和病毒性腹瀉，年齡是個關鍵，一般1歲以下的小兒，以母乳和奶粉餵養爲主，接觸污染食物的機會不大，所以以病毒性腹瀉多見。而年長兒童，進食種類複雜，較易食入細菌污染的食物，尤其是夏秋季，以細菌性腹瀉爲主。
1.蒙脫石散劑
蒙脫石散劑是一種高效消化道粘膜保護劑，口服2小時便可均勻覆蓋在整個腸腔表面，並維持6小時。能吸附致病性大腸桿菌、輪狀病毒等，並對其具有固定作用。同時，還能促進腸道細胞的吸收功能，減少其運動失調，使水和電解質流失明顯減少。它還能與粘糖蛋白相互作用，提高粘液的質量和數量，使其稠度增加，加強了腸道的粘液屏障功能，從而有效阻止病原微生物的攻擊。
2.預防疫苗
預防小兒秋季腹瀉的疫菌我國從2005年纔開始應用。目前只有我國和美國研製出了口服輪狀病毒的活疫苗。醫界認爲，服用疫苗是目前最有效的預防辦法。
當然，也不是說孩子服了這種疫苗家長就可以高枕無憂了，孩子的抵抗力是不同的，抵抗力低下時，用了疫苗也可能會發生病毒感染。所以，平時的預防措施還是很重要的。另外一個原因，因爲輪狀病毒有不同的亞型，疫苗不可能覆蓋所有的亞型，目前疫苗的覆蓋率爲47%~68%。這也是少數患兒服用了疫苗後，仍患小兒秋季腹瀉的原因之一。
有人認爲進口疫苗比較好，這是一個誤區。疫苗好不好，主要看是否與當年感染病毒的類型相匹配。由於口服輪狀病毒活疫苗接種後保持期一般爲一年，最長不超過一年半，也就是說要避免感染小兒秋季腹瀉，最好每年接種一次疫苗。
3.微生態調節劑
人體中存在很多正常細菌，如雙歧桿菌等，數量爲人體細胞總數的10倍，主要分佈於腸道，是人體生命活動所不可缺少的。如果正常細菌數量下降或比例失調，就會出現腹瀉，腹瀉又將進一步加重菌羣失調。微生態製劑是以雙歧桿菌爲主的正常活菌製劑，口服後可促進正常菌羣恢復而起到治療腹瀉的作用。經臨牀驗症，愛爾A、嗎咪愛、培菲康、乳酶生、麗珠腸樂等對小兒秋季腹瀉治療效果較好。
4.口服補液鹽
輪狀病毒對患兒最大的威脅是縮短了小腸內的絨毛。別小看了這些絨毛，由於它們的存在，在人體腸道內形成了無數的溝溝壑壑，好像向日葵一樣，自身面積很小，但加上所有的瓜子形成的溝回，面積就相當可觀了。我們的腸道也是如此，把溝溝壑壑的絨毛面積都算起來，足有一個足球場那麼大，它保證了人體所需營養的吸入與各種功能的發揮。可一旦絨毛縮短了，腸道內的吸收平衡也就被破壞了，首先水和電解質就會大量流失，導致人體這臺發動機好似沒了供油一樣，失去了動力。這種因輪狀病毒引起的腹瀉，目前沒有什麼特效藥。小腸絨毛也不可能一下長出來。
治療上，只能是補充水和電解質。據統計，嬰幼兒秋季腹瀉引起的脫水90%以上屬於輕度和中度脫水，僅10%屬於重度脫水。對急性腹瀉併發輕中度脫水的患兒，治療首選高效又價廉的口服補液鹽(ORS)。孩子每腹瀉一次，服ORS約50~100毫升，起到防止脫水的作用。口服補鹽液呈粉狀，應按說明配成水劑分次喝下。給孩子喂口服補液鹽水應該耐心，少量多次地喂，每2~3分鐘喂一次，每次用勺喂10~20毫升;這樣積少成多，約4~6小時即能糾正脫水。靜脈輸液只用於重度脫水，需要在專科醫生指導下使用。家長切不可隨意向醫生要求輸液治療。因爲濫輸液不僅會增加患兒的痛苦和家長的經濟負擔，有時會發生輸液反應，導致病情惡化。
1、注意飲食衛生
餵養前餐具應開水洗燙，不吃變質食物、不喝生水、食物存放要加罩、防止昆蟲污染。
2、合理餵養，定時定量
少讓寶寶吃富有脂肪的食物，多吃新鮮蔬菜，補充維生素B，改善胃腸功能。根據幼兒的成長情況，注意每餐定時定量，做到少量多食。添加輔食時，根據孩子生理構造情況，同樣要少量多食。同時，需要給孩子多喝水來補充水分。
3、根據氣候變化及時增減衣服
注意氣候變化，及時增減衣服，避免過熱或受涼，特別主要要避免腹部受涼。注意保持室內空氣流通。
4、加強孩子的體格鍛鍊，增強體質，增強免疫力。
5、接種疫苗是有效的預防方法
接種輪狀病毒疫苗。6-24個月的寶寶，建議每年7-9月份，即秋季腹瀉流行季節來臨之前接種輪狀病毒活疫苗，以預防秋季腹瀉。
