近年有臨牀觀察證明，該藥可引起老年男性尿瀦留，發生率約爲0.9％。這是潔黴素的藥物不良反應，還是因服藥老人患有前列腺增生，目前還不十分清楚。但已有研究證明，該藥對神經肌肉的連接通路有阻斷作用，這可能與發生老年尿瀦留有關。因此，有專家建議，在有多種抗生素可供選擇的情況下，老年男性，尤其是50歲以上的男性患者，應慎用潔黴素，對患有老年前列腺增生的患者則應禁用潔黴素。
此外，臨牀觀察還發現，潔黴素可引起過敏性休克，使用劑量過大或給藥速度過快可引起致死性藥物不良反應。所以，臨牀應用潔黴素必須慎之又慎!
