引起腺性膀胱炎的原因主要有以下四種學說。
1、感染或結石等長期刺激。膀胱內移上皮，即膀胱粘膜受細菌感染或結石異物刺激，在殘餘尿液中某些物質的長期刺激下，膀胱粘膜上皮化生，基層細胞呈爐狀增生，延伸到固有膜，形成實際上皮細胞巢狀的腺狀結構，這種膀胱炎症被稱爲腺性膀胱炎
2、由胚胎器官發育形成。部分內胚層腸上皮細胞殘留在膀胱中，可形成移行上皮下結締組織內腸上皮樣腺體。從胚胎學上看，膀胱和直腸共同起源於原始的泄殖腔，腺性膀胱炎的膀胱內腺體在形態學上與正常的腸腺類似，這些腺體可能是胚胎的剩餘發展。
3、與人類乳頭瘤病毒(HPV)感染有關。腺性膀胱炎具有乳頭狀和濾泡狀增生、上皮細胞內空泡樣病變等特點，這些特點與人類乳頭瘤病毒感染的病理特點相似，尤其是上皮細胞內空泡樣病變，被認爲是人類乳頭瘤病毒感染的特點性病理。
4、其他。還有個別報道認爲腺性膀胱炎與維生素不足、變態反應、有毒代謝產物、激素失衡、特殊致癌物等有關。
