當丙型肝炎嚴重後，患者會出現黃疸嚴重、身體虛弱無力、吐血等症狀。還會出現嚴重的併發症，如肝性腦病、上消化道出血、繼發感染等疾病。因此要早發現疾病、早治療，但是對於這些併發症，患者也要進行治療，治療詳情如下:
1、肝性腦病:低蛋白飲食。保持大便通暢，可口服乳果糖。諾諾氟沙星抑制腸道細菌等措施氨的產生和吸收。靜脈用乙酰谷酰胺、谷氨鈉、精氨酸、門冬氨酸鉀鎂有一定降血月氨等假性神經遞質，從而促進甦醒。靜脈滴注0.2—0.6g/d。維持支鏈/芳香氨基酸平衡可用氨基酸製劑。出現腦水腫表現者可用20%甘露醇咐呋塞米(速尿)快速滴注，必要時可兩者合用，但須注意水電解質平衡。治療肝性腦病的同時，應積極消除其誘因。
2、上消化道出血:預防出血可使用組胺H2受體拮抗劑，如雷尼替丁(ranitidne)、法莫替丁、西米替丁，有消化道潰瘍者可用奧美唑。補充維生素K、C。輸注凝血酶原復物、新鮮血液和血漿、濃縮血小板、纖維蛋白原等。降低門靜脈壓力，如心得安等。出血時可口服凝血酶或去甲腎上腺或雲南白藥，應用垂體後葉素，Reptilase，生長抑素，安絡血。必要時在內鏡下直接止血(血管套扎，電凝止血，注射硬化劑等)。肝硬化門脈高壓引起出血還可用手術治療，出血搶救時應消除患者緊張情緒，必要時用地西泮，並給氧。出血是其他嚴重併發症常見誘因，治療出血時應同時預防其他併發症的發生。
3、繼發感染:重型肝炎患者極易合併感染，部分來自院內感染，因此必須加強護理，嚴格消毒隔離。感染多發生於膽道，腹膜，呼吸系，泌尿系等。一旦出現，應及早應用抗菌藥物，根據細菌培養結果及臨牀經驗選擇抗生素。膽系及腹膜感染以革蘭陰性桿菌多見，可選用頭孢菌素類，或喹諾酮類，腹膜感染者尚可試用腹腔內注射抗生素。嚴重感染可選用強效廣譜抗生素如頭孢他啶，頭孢曲松，頭孢吡肟，亞胺培南，或聯合用藥。但要警惕二重感染的發生，有真菌感染時，可選用氟康唑。
4、肝腎綜合徵:避免腎損藥物，避免引起血容量降低的各種因素。目前對肝腎綜合徵尚無有效治療方法，可試用多巴胺、立其丁、呋塞米等，大多不適宜透析治療。
5、人工肝支持系統:非生物型人工肝支持系統已應用於臨牀，主要作用是清除患者血中毒物質及補充生物活性物質，治療後可使血膽紅素明顯下降，凝血酶原活動度升高，但部分病例幾天後又恢復到原水平。非生物型人工肝支持系統對早期重型肝炎有較好療效，對於晚期重型肝炎亦有助於爭取時間讓肝細胞再生或爲肝移植作準備。由於肝細胞培養不遺，生物型人工肝研究進展緩慢。近期有單位將分離的豬肝細胞應用於生物型肝功肝，其效果及安全性有待評估。
6、肝移植:已在我國多家醫療單位開展，並已取得可惜的成效，爲重型肝炎終末期患者帶來希望。核苷類似物抗病毒藥的應用，可明顯降低移植肝的HEV再感染。肝移植是末期丙型肝炎患者的主要治療手段，術後5年生存率可達30%—40%。由於肝移植價格昂貴，獲供肝困難，排異反應，繼發感染(如鉅細胞病毒)等阻礙其廣泛應用。
7、淤膽型肝炎:早期治療同急性黃疸型肝炎，黃疸持續不退時，可加用潑尼鬆40—60mg/d口服和靜脈滴注地塞米松10—20mg/d，2周後如血清膽紅素顯著下降，則逐步見諒減量。
9、慢性乙型肝炎和丙型肝炎:病毒攜帶者可照常工作，但應定期檢查，隨訪觀察，並動員其做肝穿刺活檢，以便進一步確診和作相應治療。
8、肝炎肝硬化:可參照慢性肝炎和重型肝炎的治療，有脾功能亢進和門脈高壓明顯可選用手術或介入治療。
