原發病人積極治療原發病。治療單純性便祕是改善飲食內容，補充水分和含纖維素多的食物(穀物、蔬菜等)。同時訓練排便習慣。藥物治療只在必要時臨時使用。
1、人乳餵養嬰兒的飲食矯正
人乳餵養嬰兒很少便祕。發生的情況下，除了喂人乳之外，還要加入加糖的菜水和橙汁(用新鮮的橙汁擠壓，市場上銷售的橙汁打開瓶子容易污染)、番茄汁、山楂和棗汁。4個月以上可加入菜泥或煮熟的水果泥。母乳不足時，可加1-2次加8%糖的牛乳。蜂蜜水每日60～90ml，也有幫助。
2、人工餵養嬰兒的飲食矯正
人工餵養兒較易便祕，但如合理加糖及輔食，可避免便祕。如果發生，可以將牛奶中的糖增加到8%，並添加果汁(如番茄汁、橙汁、菠蘿汁、棗汁和其他煮果汁)來刺激腸蠕動。大較大的嬰兒可以加入蔬菜泥、蔬菜末、水果、粥類等品。再大一些可加較粗的穀類食物如玉米粉、小米、麥片等製成粥。1~2歲，加入各種輔食，每天牛奶量500ml就足夠了，可以多吃粗糧食、紅薯、胡蘿蔔和蔬菜。有條件者可加瓊脂果凍。營養不良的兒童便祕，要注意補充營養，逐漸增加入量，營養狀況好轉後，腹肌、腸肌增長、張力增加，排便自然順暢。
3、訓練習慣
大便是反射性運動，兒童通過訓練可以養成按時排便的習慣。一般來說，3個月以上的嬰兒可以開始訓練，早上餵奶後用大人的雙手支撐，坐在盆裏或排便椅子上，按時執行半到一個月就能養成習慣。培養後不要隨意改變時間。對於年長的慢性便祕，除了鼓勵多運動、纖維多的食物外，還要按時通便，養成良好的習慣。
4、中醫治療
中醫認爲慢性便祕多系津虧腸燥所致，治以滋陰潤腸法。輕者可以使用單味郁李仁，每次咀嚼3~5粒，每天1~2次，或者每隔一天服用。重者經常經常用三仁丸(瓜菜仁、郁李仁、火麻仁各等量製作密丸，每丸3g)每次1丸，每天1~2次，幼兒減半。老年人可以服用麻仁滋脾丸，每天1~2丸，通便後停止服用。
5、其他療法
幼兒每晚睡覺前可以服用鎂乳，每次0.5~1ml/kg，或者液狀石蠟每次0.5ml/kg，也可以用兩種藥製成合劑，不僅僅是石蠟油，肛門也容易泄漏。以上藥物連續3~5天，第二天早上可以訓練大便。爲了避免吸入，嬰兒不使用蠟油。兒童也可以使用苯酚每次3毫克/公斤，睡前穿。急性便祕和糞塊堵塞，可以用開塞露(甘油和山梨酒精製劑)5~10ml注入肛門，刺激直腸排便的家庭可以用肥皂條插入嬰兒的肛門排便，也可以用小指戴上皮手套塗上少量的石蠟油和凡士林，插入肛門排便。灌腸的方法刺激性強，容易養成習慣，非特殊需要時不採用。
