甲肽蛋白又稱AFP，是比較特異性的肝癌腫瘤標誌物。甲胎蛋白在醫學上主要具有輔助原發性肝癌診斷、評價肝癌預後和檢測療效等作用，許多肝癌患者和腫瘤患者的發生與甲胎蛋白密切相關。
由於甲方蛋白是胎兒初期的，出生後2~3個月被白方蛋白所取代，健康成年人體內的甲方蛋白也只是微量，人體幹細胞和生殖腺胚胎組織發生惡變時，甲方蛋白相關基因再次合成活化，甲方蛋白濃度再次上升。
臨牀上也通過血液中AFP的濃度值來診斷是否有原發性肝癌和滋養細胞惡性腫瘤的可能性。
甲胎蛋白的正常值用化學的發光法或者放免法檢測都是0~9的ng/ml或者是0~25ng/ml。超過200ng/ml時，請注意是否有原發性肝癌。如果持續超過200ng/ml，持續8周，則結合圖像數據。例如，CT、肝臟的NRCT、超聲波等影像資料等全面判定。如果圖像數據顯示佔有率，高度懷疑是原發性肝癌。但是，不能立即定論。甲胎蛋白濃度高於200ng/ml，也出現在慢性活動性肝炎和肝硬化的患者中，必須結合肝功能進行判斷。
治療後，肝功能下降，甲蛋白濃度也下降，甲蛋白的上升可能與炎症有關，甲蛋白不下降或持續上升，肝功能好轉時，反而懷疑是否有原發性肝癌。此外，甲胎蛋白超過200ng/ml排除妊娠，性腺腫瘤，如畸形腫瘤、睾丸腫瘤等來自胚胎和性腺的腫瘤。我們必須排除這些腫瘤是因爲這些腫瘤也會上升。
