手術切除是胃癌的主要根治方法。但是，如果患者有嚴重的疾病，無法忍受手術，或者因爲老年人不想手術的人，可以在內鏡下治療。隨着內鏡技術的發展，治療內容豐富，傳統的外科方式逐漸被取代。目前，內鏡下局部注射、電灼、激光、微波等可以去除癌症爐，早期胃癌可以達到根治的目的。晚期患者通過內鏡治療也能改善症狀，提高生存質量，延長生存的目的。
所謂早期胃癌是指侷限性的，只侵入粘膜層和粘膜下層的胃癌。由於癌症生長表面較淺，病竈較小，可局部注射無水酒精或5-氟脲喹，使腫瘤病竈局部壞死達到治療目的。
胃癌組織浸潤肌層、漿膜層或漿膜外者爲中晚期胃癌，通常稱爲進展期胃癌。由於進展期胃癌患者不能接受手術治療，病變廣泛，轉移，患者全身狀況差，或者有其他疾病，無法忍受手術，切除手術的患者手術後也有復發者，這些患者經常因癌症增加而堵塞腔道和出血。
胃底癌侵入噴門和食管引起食道堵塞，胃竇癌引起幽門堵塞等。內鏡局部治療無需全麻，全身反應減少，直視治療對病竈具有直接有效、副作用小的特點。因此，在全身化學療法的基礎上和局部化學療法、燒電、激光和微波等，不僅能提高生存率，還能有效地治療幽門、噴門梗阻、癌症爐出血等病變。
內鏡直視下注入高濃度抗癌乳化劑，病竈局部滯留時間長，胃癌組織及其所屬淋巴內藥物濃度高，日本已將內鏡直視下注射化療藥物列爲進展期胃癌常規治療方法之一。這種治療一般分爲全身化學療法和局部化學療法和單用局部化學療法兩種。
在內鏡直視下仔細觀察胃癌病竈的全貌，分別在癌竈結節和癌竈與鄰近粘膜的邊界注射化療藥物，注射點儘量分散在多點並存。癌症爐的範圍很大的話，注射結束後，可以向癌症爐整體噴灑一定量的化療藥物。
由於癌症引起食道噴門、胃竇致癌性狹窄、手術瘢痕性狹窄引起的局部梗阻，可採用內鏡直視激光、微波、電灼、高頻刀切割等方法治療，在一定程度上解除患者痛苦，最近療效良好。
累積食管的噴門癌也可以用各種擴張器治療，擴張後在狹窄的地方放置人工食管也是一種緩慢的治療方法。幽門癌性梗阻患者經過微波、激光、電凝局部反覆治療後，症狀經常改善，如局部聯合化療注射，其治療效果更好。
。
