一般，治療膀胱炎主要是以藥物治療措施爲主，但需要注意的是，抗菌藥物的選擇一定要明確致病菌，若是盲目應用的情況下，這樣很難治癒疾病，並且即便是有一定的治療效果，也會再一次的復發。下面就藥物治療膀胱炎的方式進行具體介紹：
1.首次發作時，醫生會給患者使用抗生素，如諾氟沙星、複方新諾明、阿莫西林、呋喃西林等。患者用藥3～7天后大多可治癒。若膀胱炎反覆發作，醫生則會 讓患者先做尿細菌培養及藥物敏感試驗，根據藥敏情況使用抗生素。對於老年，醫生大多會給他們選用那些在腎組織及尿液中藥物濃度高、腎毒性小的藥物，以儘快 有效地控制炎症。若經治療仍反覆發作，醫生會採用抑菌療法，常可取得良好效果。
2.若感染反覆發作，療效不佳，醫生會檢查患者的免疫功能。若患者免疫功能低下，醫生會給患者服用免疫增強藥物，如中藥玉屏風散。患者也可採用自然療法如練習氣功、太極拳等，以增強機體的抗病能力。
3.若患者久治不愈或反覆發作，醫生會考慮作相應檢查，以排除其他疾病，如尿道口附近是否有感染(陰道炎、宮頸炎、前列腺炎等)，是否有尿路梗阻(如結 石、前列腺增生等)，有無全身性疾病(如糖尿病、結核病、肝病等)。經抗生素治療後療效不佳的患者，醫生還會進行其他病原體檢查，如支原體、衣原體、真菌 等。
需要注意的是，有些患者的致病因素並不是非常明確的，這樣的情況下，在治療上需要有特殊的方式，注意區分兩種情況，若是患者的症狀不明顯的情況下，可以觀察治療，必要的情況下，可以考慮手術治療。
