咳嗽有痰扁桃體發炎咽喉腫痛，可應用抗生素、解熱鎮痛、糖皮質激素類藥物改善，或應用含片、噴霧、含漱液等藥物輔助治療。
扁桃體炎症是由於致病微生物引起的感染性疾病，多數患者發炎可合併細菌感染，需通過血常規檢測確定患者感染程度，若確定患者白細胞、中性粒細胞等炎症指標有所升高，需給予抗生素藥物抗感染治療。臨牀常用抗生素包括青黴素類藥物（阿莫西林）、頭孢菌素類藥物（頭孢呋辛、頭孢他啶）等。
咽喉腫痛過於嚴重，或伴有高熱、咳痰等症狀，可應用解熱鎮痛類藥物，或應用糖皮質激素治療，如布洛芬、塞來昔布、美洛昔康等。也可使用含片、噴霧、含漱液等藥物，保持口腔和咽喉部清潔，幫助排除咽喉部粘液。
