兔脣的形成機理現在來說還沒有完全明確，但是一般是由兩個方面的因素影響的，分別是遺傳因素和環境因素，營養、內分泌、感染等也對其有一定的影響。
從遺傳方面來講，有兔脣，也就是脣裂的患者，在其直系親屬或者旁系親屬中是能發現類似畸形的發生的，這就是說它與遺傳相關的原因，有遺傳學研究認爲脣裂屬於多基因遺傳性疾病。
從環境方面來考慮，在妊娠的前三個月中，當母體的生理狀態受到侵襲或干擾時，是可能影響到胚胎頜面部的生長髮育的，比如準媽媽缺乏營養，不忌菸酒，或者受到一些物理損傷等，都可能造成影響。
