性識別傷殘是指孩子對自己性別的認識、行為與自己真實的解剖特徵相反。也就是說，男性(女性)的孩子穿著女性(男性)的服裝，行為喜歡女性(男性)的孩子)，或者繼續否認自己的身體有男性(女性)的解剖特徵。
正常的孩子只要兩歲左右，就模糊區分其他幼兒是和自己一樣還是不一樣，而且傾向於喜歡同性幼兒。3歲左右可以識別自己是男性還是女性。在3歲時兒童選擇玩具會選擇與自己性別相似的。到了4歲時，則可正確的識別玩具娃娃是女性還是男性。另一方面，男孩或女孩自幼其行為就有性別差異，如女孩喜歡玩洋娃娃，而男孩喜歡玩坦克、槍。一般在2歲時其玩耍的行為就有性別的差異，至3～4歲時，則十分明顯。而真正性愛的發育則是青春期以後的事。而有性識別障礙者，到了相應的年齡仍不能識別自己的性身份和/或行為舉止像異性。這種疾病在3~7歲的孩子身上，但不常見。廣東省人民醫院心理精神科李剛
只由於環境教育不良造成的人，改變環境後才能治癒。有明顯的紊亂傾向和解剖生理因素難以去除的人，很難治療。Green(1987)追蹤研究了44例男性識別障礙者和兒童，初診年齡平均為7.1歲(4~12歲)。追蹤時平均18.9歲(14~24歲)。結果發現患兒組有75%的雙性或同性幻想，80%的同性或雙性行為。對照組沒有同性或雙性幻想者，只有1例(4%)有同性行為。以上資料表明，這類患者成年後仍有相當數量的同性戀。
對兒童從小應培養他們對自己性別的正確辨別。男孩應著男裝、玩具也應富有男性氣質，如槍、汽車、飛機、球、積木等。且幼時應多讓他觀察、模仿父親的勇子漢行為並多與男孩為伍。女孩應該穿女裝，玩洋娃娃等。小時候和女孩子在一起。父母不應該根據自己的興趣來形成孩子的性別，這對孩子性別識別能力的發展有害。同時，孩子們應該避免高度焦慮和緊張。特別是對於性格傾向異性的孩子，必須更早注意教育。對於太安靜害羞的男孩，應該培養活躍勇敢的性格。
對於障礙者可採用行為治療、認知治療和精神分析治療。對於父母心理不健康或家庭矛盾者，應注意對父母的心理治療或家庭治療。
對於有生理解剖異常者，應積極治療原發病。
