核酸檢測一般不會出現假陽性，出現假陽性的主要原因多是因為標本汙染，主要有以下幾種情況可能會導致核酸檢測出現假陽性：
1、標本汙染
如果工作人員在收集標本時容器被汙染，或者在放置標本時，如果容器密封不嚴病毒外洩，容器與容器之間會發生相互交叉汙染。其次相關工作人員在提取核酸模板時，如果加樣器汙染也會導致要本間發生汙染的情況發生。
2、氣溶膠汙染
空氣與離心機離心和液體表面進行摩擦時，由於操作比較劇烈，這次如果相關工作人員在反覆吸樣和開蓋時就會導致氣容膠發生汙染。其次氣溶膠中的小顆粒會分散在實驗室的空氣中，可能會落到PCR儀、驗檯面、吸頭盒等地方，形成叉感染。
3、實驗室中克隆質粒汙染
實驗室中的克隆質粒在被純化時需要的用具和試劑比較多，在活細胞內質粒，活細胞的繁殖速度更快，其生命力更強，如果此時造成汙染，那麼也會導致核酸檢測假陽性。
4、PCR試劑汙染
PCR試劑在調配的過程中，有可能被雙蒸水、加樣槍、容器等汙染導致核酸出現假陽性的情況。
5、PCR擴增產物汙染
PCR擴增產物汙染是一種最常見的汙染問題，PCR產物的拷貝量大於1013copy/mL,即使被很少量的PCR產物汙染，就會導致假陽性的發生。
