臨床診斷心率失常是不是由心肌炎引起的，必須結合病史、臨床表現和輔助檢查來判斷。此外，心肌炎也可能是由細菌感染引起的，如鏈球菌感染引起的風溼風溼性熱也可能導致風溼性心肌炎。根據血象、血沉、抗病史，與病毒性心肌炎不難識別。那麼，如何判斷心率異常是性心肌炎引起的？主要有
(1)首先感染，特別是上呼吸道感染，發熱、關節疼痛、全身疲勞等症狀。少數患者伴有噁心、嘔吐等消化道症狀。
(2)之後出現心悸、胸悶、心前區隱痛、頭暈、呼吸困難等心肌炎症狀。
(3)體檢發現與發熱程度不平行的心動過速或其他心率異常，部分患者心臟擴大，心音發生變化，可以聽到第三心音或第一心音減少或第四心音奔馬律。
(4)實驗室檢查:白細胞計數上升或不高，急性期紅細胞沉降率增加，血清酶增加穀草轉氨酶、乳酸脫氫酶、磷酸肌酸激酶等。心電圖顯示STT的變化，r波減少，病理性q波，約1/3的患者可以阻斷I度到ii度的房間傳導。
(5)病因學檢查:咽拭子和糞便可分離病毒，血清中特異抗體(中和、血凝機制、補體結合試驗)提高，IgM滴定度提高。心肌活檢可以從心肌中分離病毒。
