睪丸萎縮是由於某種原因睪丸逐漸萎縮變小的情況，一般是由以下原因造成：
1、藥物影響。長期服用某些有毒性藥物，例如砷劑，或者反覆使用對抗雄激素的雌激素類藥物，例如乙芪酚等，都會引起萎縮。
2、病毒感染是誘發兒童與青少年睪丸的萎縮最為常見的病因。尤其是流行性腮腺炎病毒，俗稱為痄腮病。當睪丸受此病毒侵襲後，睪丸內的生精組織會受到破壞，睪丸體積縮小，質地變軟。
3、炎症重度睪丸炎。發病時睪丸腫脹、疼痛，可以持續多日。由於細菌侵犯而造成睪丸組織破壞，導致睪丸組織發生萎縮。
4、放射性物質影響。凡是較長時間接觸放射性物質者，例如長期從事X線、同位素等職業人員，如未作很好保護，會引起萎縮症。
5、損傷或撞擊造成。損傷陰囊或睪丸部位發生過撞擊性損傷，造成陰囊血腫或睪丸裂傷等，即使創傷癒合，睪丸也會長期處於供血不充裕狀態，發生萎縮。
