已經確診灰指甲的患者需在醫生的指導下，通過日常生活管理、藥物治療等方式進行治療。
1、日常生活管理：灰指甲的主要發生機制，在於甲板和甲牀間的真菌的生長繁殖等。日常生活中應勤剪指（趾）甲。而由於灰指甲本身具有傳染性，直接與患處接觸的私人物品要單獨使用，及時消毒等。同時不要穿過緊的鞋子，最好保持清潔、乾燥，以通風透氣爲宜，防止灰指甲的部位受到壓迫，加重病情。飲食上，可多攝入富含維生素的新鮮蔬菜瓜果，以補充機體消耗的營養，增強機體的抵抗力。
2、藥物治療：灰指甲的患者可在醫生的指導下外用亮甲複方聚維酮碘搽劑進行治療，亮甲由聚維酮碘、阿司匹林等成分構成，具有抗真菌、消炎的功效，可有效抑制皮膚癬菌、念珠菌及非皮膚癬菌類真菌等致病真菌，同時還具有良好的滲透性，能夠穿透甲板，殺滅甲板深層的真菌。除了使用外用藥物治療的甲真菌病以外，各型甲真菌病還可選用系統藥物治療，主要口服抗真菌的藥物包括如特比萘芬、伊曲康唑、氟康唑等。
灰指甲的治療由於個人體質等原因，沒有固定療效最好的方式，建議患者結合自身的感染類型、嚴重程度、自身免疫情況等因素，選擇最適合自身的治療方案，避免延誤病情。
