1、肛門竇炎:直腸炎不及時治療，可併發肛門竇炎等肛門腸病，有繼發肛門周圍膿腫的危險。
2、肛門管炎:這是本病的併發症，經常與直腸炎並稱爲肛門管直腸炎，肛門管炎長期拖延也有癌變的危險。
3、腸息肉、結腸癌:直腸炎5年以上，腸道潰瘍面在炎症長期刺激下容易異常增生，引起腸息肉，1釐米以上腸息肉癌變率極高
4、腸狹窄:病變廣泛，病程持續5-25年以上，其部位直腸，臨牀無症狀，嚴重時腸堵塞，本病腸狹窄時，應警惕腫瘤，鑑別良性惡性。
5、便血:便血是本病的主要臨牀表現之一，便血的數量也是衡量病情的重要指標。長期慢性出血可引起缺鐵性貧血
6、特發性潰瘍性結腸炎:特發性潰瘍性結腸炎的原因不明，與免疫有關的疾病，多以潰瘍爲主，累積結膜粘膜，青壯年多見。腹痛常在左下腹或全腹壓痛明顯，伴腸鳴音亢進。有食慾減退、體重下降、營養不良等症狀。可行乙狀結腸鏡和活組織檢查以利診斷。
7、腸結核：起病緩慢，多位於右下腹部，可有陣發性絞痛，腸鳴音增強，常有大便習慣改變，幹、稀交替。輕者只有稀便，重者爲粘液膿血便。噁心、嘔吐、腹脹、食慾減退。體檢僅有右下腹壓痛。輔助檢查:血沉快，結腸菌試驗陽性，大便培養可找到抗酸桿菌。給予纖維腸鏡檢查以確認急性胃腸炎。
