母嬰傳播是新生兒感染乙肝的重要原因，在孕期孕婦都有可能將乙肝病毒傳染給胎兒，其中以下三個時期最易發生母嬰傳播。
1.產前傳播
產前傳播即宮內感染，是指乙肝病毒通過胎盤屏障在胎兒肝臟內定位和複製，引起胎兒宮內感染。乙肝病毒通過胎盤屏障的機制尚不清楚，推測可能是由於胎盤屏障受損或通透性改變引起母血滲漏造成，目前治療方法一般爲在孕期給孕婦注射乙肝免疫球蛋白等藥物來預防產前傳播。
2.產時感染
產時感染指胎兒通過產道時，如皮膚或黏膜招致產傷或潰破，含有乙肝病毒母親的血液、羊水、陰道分泌物經過新生兒擦傷的皮膚或潰破的組織進入新生兒體內導致感染。目前有研究表明，行剖宮產生產的新生兒感染乙肝病毒的機率小於自然分娩者，因此有乙肝的產婦最好是選擇剖宮產。
3.產後感染
產後感染是通過母乳餵養和其他生活上的密切接觸而傳播。如果產女患有乙肝，在後可通過哺乳使新生兒感染乙肝，這一點已經得到證實，有研究乳汁中含乙肝病毒標誌物HBsAg、HBeAg、HBV-DNA是具有傳染性的直接指標，不宜哺乳。
