少精症最直接、最嚴重的危害就是不育。根據標準，精子數量少於2千萬/毫升則爲少精症。其實少精症患者精液中還是有不少精子的，可是爲什麼還會造成不育呢?首先要了解精子與卵子結合的過程。
在性交過程中，大約有3億精子可能會進入陰道，但是隻有一個精子可能穿過重重障礙，使卵子受精，最終制造出一個胚胎。卵子在壺腹部停留，並在此處受精。卵子一般停留在輸卵管壺腹部等待受精。
正常情況下，男子一次射入女子陰道的精子有2~4億個，它們聚集在子宮頸口，等待進入子宮。但子宮頸管道又細又長，大部分精子無法入內，只有5000個精子能進入了子宮腔。
到達輸卵管壺腹部的精子只剩下30~50個，它們一起圍攻等在那裏的卵子，並集體尋找突破口。卵子的外層被一層透明的薄膜保護着，這使它看起來像一個懸浮在天體中的漂亮的星球。此時經過種種障礙的精子終於與卵子相遇。
而少精症患者一次射精的精子數量低於2千萬個，一般是因其他原因或睾丸本身的原因，使睾丸生精能力減弱，精子量纔會減少，並且伴有精子質量下降，精子活力降低，僅有的一部分精子根本沒有能力突破重重障礙與卵子結合，而導致男子不育。
