肺部真菌感染影響肺部功能，康復訓練以改善肺部功能爲主要目的，訓練方式包括：運動訓練、呼吸訓練。
1、運動訓練
運動訓練包括：下肢訓練、上肢訓練。下肢訓練主要以腳蹬自行車、散步、慢跑爲主。訓練時應把握把握好訓練時間，以10~15分鐘爲佳；上肢訓練包括：啞鈴訓練、飛鏢訓練、彈力繩訓練、投籃訓練、上下肢阻力自行車訓練。
2、呼吸訓練
呼吸訓練包括：腹式呼吸、縮脣呼吸。通過呼吸訓練可鍛鍊肺部呼吸功能，減少肺部纖維化進程，改善呼吸困難、呼吸窘迫等呼吸系統症狀。呼吸訓練應以循序漸進爲原則。訓練時間、長強度應結合自身實際病症、體質而定。
