丙型肝炎和艾滋病有相似之處。二者傳播途徑類似，都是通過輸血、吸毒等途徑傳播，因此高危人羣重疊。由於這兩種病毒都是RNA病毒(乙型肝炎是DNA病毒)，變異很快，因此不易開發出疫苗來預防。
但是，丙型肝炎的危害絕不亞於艾滋病，甚至更大。無論兒童還是成人，如果不接受治療，70%~80%的丙型肝炎感染者會轉爲慢性丙型肝炎。而成人感染乙型肝炎病毒後，僅有5%~10%會轉成慢性。更糟糕的是，丙型肝炎發展爲肝硬化、肝癌的比例都在乙型肝炎之上。
美國的研究表明，丙型肝炎若不積極治療，20年後發生肝硬化的比例爲10%，30年後則爲20%。由於肝臟是一個沉默的器官，感染病毒後患者可以很多年沒有任何症狀，而一旦發病，往往病情已經很重了。因此，丙型肝炎是一個零存整取的過程，儘管目前疾病還沒顯山露水，但再過10年，就會出現大量肝硬化患者。對於肝硬化失代償患者治療起來會非常麻煩，很多患者都需要肝移植。因此，從發病患者數和遠期後果看，丙型肝炎的實際危害可能遠大於艾滋病。
