潰瘍性結腸炎是腸壁表面的病變，所以腸鏡是最重要的檢查。
1、結腸鏡所見①粘膜有多發性淺潰瘍，伴充血、水腫，病變大多從直腸開始，且呈瀰漫性分佈。②粘膜粗糙呈細粒狀，粘膜血管模糊，易出血或附膿血性分泌物。③可見假息肉，結腸袋往往變鈍或消失。
2、粘膜活檢組織學檢查呈炎症性反應，同時可見糜爛、潰瘍、隱窩膿腫、腺排異常、杯狀細胞減少和上皮變化。
3、鋇劑灌腸所見①粘膜粗亂或有細顆粒變化。②多發性淺龕影或小的充盈缺損。③腸管縮短，結腸袋消失可恥下場呈管狀。
4、手術切除或病理解剖學可見肉眼或組織學的潰瘍性結腸炎特點。
