肛竇炎的後遺症之一就是肛周膿腫或肛瘻，會引發肛門周圍紅腫、疼痛及潰膿等嚴重的後果。有些肛竇炎患者還會出現排便不盡感或慢性炎症等後遺症。
1、肛周膿腫或者肛瘻
肛竇炎通常都是肛門周圍膿腫、肛瘻的前驅表現。若發病後沒有及時進行規範治療，極有可能會導致這些後遺症，從而出現肛門周圍紅腫、疼痛及潰膿嚴重的後果。
2、排便不盡感
人的肛管當中有着豐富的神經纖維，還有很多神經節，從而形成附屬感覺器官。若患上肛竇炎，治療不及時或不規範，患者有可能會出現排便不盡感，也會伴隨異物嵌入肛內的感覺和下墜感。
3、慢性炎症
肛竇開口是向上的，若患上肛竇炎，分泌物會大量增加，肛竇部位會積存大量分泌物。時間長了，這些分泌物會堵塞肛竇口，感染不容易控制，最終形成慢性炎症。
