藿香正氣丸的副作用主要有偶爾會出現藥疹、紫癜、休克等過敏反應，還可能出現腸梗阻、上消化道出血，對於小孩兒服用還可以出現低血糖的症狀，所以這個藥物一定要在醫師的指導下才能進行服用。對於孕婦來說一定要禁忌服用，對於這個藥物合成粉有過敏的一定要禁忌服用。
對於風熱型的感冒主要表現是發熱、怕風、出汗、頭脹痛、口乾、想喝水或者是咽乾、眼痛、鼻塞、流黃濃鼻涕、咳嗽、咳黃黏痰等等着風熱感冒症。
