引起女性習慣性流產的原因包括子宮因素、內分泌因素、遺傳因素、免疫因素以及其他因素等等。對於習慣性流產，女性首先要找出它發生的具體原因，之後再進行鍼對性處理，以避免流產的再次發生。
1.子宮因素：女性出現子宮畸形、子宮血液供應不佳、子宮內膜類固醇受體缺乏、黏膜下子宮肌瘤、宮腔粘連以及宮頸內口功能不全等，都可能導致習慣性流產。
2.內分泌因素：女性在懷孕之後激素變化會十分明顯，而激素的變化對於妊娠的維持又起到了重要作用。如果女性發生內分泌功能失調，比如原發性絨毛膜促性腺激素分泌不足、原發性孕激素分泌不足以及腎上腺皮質、甲狀腺、胰腺等功能障礙，也都會影響到卵巢及黃體的形成，從而影響到胚胎的正常發育，引起流產。
3.遺傳因素：女性發生習慣性流產還可能因胚胎的染色體結構與數目發生異常導致。發生這種情況大多是由於夫妻中有一方或者雙方都出現了染色體異常引起的，此外，一些夫妻雙方可能都沒有染色體異常的現象，也不排除胎兒出現染色體異常。
4.免疫因素：如果出現ABO血型不合，胎兒可發生溶血癥，它的發生率要比Rh型血型不合的發生率更高。ABO血型不合主要表現爲新生兒早期黃疸，但也有一些會引起習慣性流產。
5.其他因素：孕婦如果患有系統性紅斑狼瘡、慢性腎功能不全以及陰道、宮頸感染了某種真菌、病毒等，也都可能引起流產。此外，慢性胎盤功能不全也會導致晚期流產、死胎等。孕婦所生活的環境不佳，比如長期處於噪音、高溫等環境，或者長期接觸有毒化學物質，都可能引起習慣性流產。
