早上起來腳後跟筋疼的原因可能是類風溼關節炎或跟腱炎，應根據具體原因選擇治療方式。
類風溼關節炎主要表現爲遠端關節痠痛，多數伴有晨僵，因此早上起來腳後跟筋疼可能與類風溼關節炎有關。一般起牀活動後疼痛可緩解，受涼刺激後症狀加重。類風溼關節炎治療的主要目的在於減輕炎症反應，抑制病變發展，儘可能的保護關節和肌肉的功能，最終達到病情完全緩解或降低疾病活動度的目標。常用藥物有抗風溼藥、糖皮質激素和非甾體抗炎藥，如來氟米特、羥氯喹、塞來昔布等。
跟腱是連接小腿後方肌羣與跟骨的帶狀肌腱纖維，張力通過肌肉收縮傳遞到跟腱。跟腱炎一般指跟腱急慢性勞損後形成的無菌性炎症。其主要症狀是足跟部上方的、內部的疼痛、僵硬、痠痛、壓痛，並在活動後加劇，痛感通常會在清晨或者劇烈運動後的休息期間發作，因此早上起來腳後跟筋疼可能是跟腱炎導致。應減少跟腱活動，注意休息，防止損傷加重；可使用超聲、微電流神經刺激、鍼灸等物理治療的方式進行緩解；藥物治療主要服用非甾體抗炎藥，如布洛芬、雙氯芬酸鈉、萘普生等。
