懷孕一般不建議喝藿香正氣水，藿香正氣水中含有酒精，可能會導致胎兒智力下降，嚴重誘發流產，不利於胎兒發育。
藿香正氣水裏的藿香、陳皮等藥物用於治療中暑、嘔吐、霍亂等症狀，藿香正氣水裏含有酒精，對酒精過敏的孕婦可能會引起孕婦腸胃不適，導致過敏，出現溼疹、瘙癢、蕁麻疹等症狀。酒精可能會通過胎盤到達胎兒體內，造成胎兒發育遲緩甚至先天性畸形。也可能導致胎兒智力低下，嚴重者誘發流產或早產。且藿香正氣水味道比較重可能會導致孕婦孕吐加重。
懷孕期間孕婦可多喝冬瓜湯、芹菜枸杞葉粥、雪梨湯來增進食慾進行降溫，應合理安排飲食，避免高糖食品，同時需要適當增加膳食纖維和維生素比較豐富的水果來促進腸胃蠕動。
懷孕期間如果出現熱感冒及中暑情況，可以在醫生指導下服用一些孕婦專用藥或者多喝白開水。通過運動、飲食來調整，儘量不要通過藿香正氣水來進行治療。
