區分卵巢囊腫屬於良性還是惡性，是診斷和治療該類腫瘤的關鍵。既不要把良性腫瘤當成惡性腫瘤，給患者帶來沉重的精神負擔，遭受不必要的痛苦;也不要把惡性腫瘤當成良性腫瘤，貽誤治療時機，造成不可挽回的後果，區分卵巢囊腫是良性還是惡性有時有一定困難，但以下幾點可供鑑別：
病史方面：良性卵巢囊腫患者病程長，囊腫逐漸長大，多無不適症狀;而惡性者病程短，囊腫迅速長大，且有時可伴有發熱。一般情況：良性者多爲生育期婦女，一般情況良好;而惡性者發病多見於青春期前少女、青少年或絕經後婦女，病情發展快，早期即有轉移病竈，並迅速出現消瘦等惡性病變表現。
體徵：良性者常爲單側，可活動，表面光滑，包膜完整，囊性，不伴腹水;而惡性者有時爲雙側，不活動，與周圍組織常有粘連，部分爲實性，表面不光滑，可能穿破包膜，種植在腹腔或盆腔內，在子宮直腸陷凹處可觸到固定的結節，常伴有血性腹水，如抽吸腹水檢查可能查到癌細胞。
