肝膿腫的分型包括細菌性肝膿腫，阿米巴性肝膿腫，真菌性肝膿腫。
1、細菌性肝膿腫
細菌性肝膿腫是由化膿性細菌所引發的肝內感染，較常見的革蘭氏陰性菌和厭氧菌。感染途徑主要是膽道感染，可從膽道感染直接蔓延至肝臟。也有可能是腹腔內其他臟器感染，後經門靜脈進入肝臟。此外，全身各個部位的感染經肝動脈進入肝臟也會引發細菌性肝膿腫。
2、阿米巴性肝膿腫
阿米巴性肝膿腫指由阿米巴原蟲所引發的肝膿腫。阿米巴原蟲可從結腸阿米巴潰瘍經門靜脈系統進入肝臟，在肝臟當中溶解組織，最終形成膿腫。隨衛生條件改善，阿米巴性肝膿腫發病率有所降低。
3、真菌性肝膿腫
真菌性肝膿腫是由真菌感染所致肝膿腫，免疫力低下及濫用抗生素的人較易患上該病。不過真菌性肝膿腫臨牀較少見，發病率不足10%。
