不論是原發性閉經或是繼發性閉經，其發生的原因既有共同之處，也有不同之處。正常月經週期是由丘腦下部——垂體——卵巢軸各個環節的內分泌功能所調節，如果任何一個環節發生障礙就會發生月經失調，有時導致閉經。控制正常月經週期的主要環節有四個，我們從每個環節逐一進行分析。
⑴ 子宮性閉經：閉經的原因在子宮，月經調節功能正常，卵巢有功能，但子宮內膜對卵巢不能產生正常的反應，故稱子宮性閉經。引起子宮性閉經的常見疾病有：子宮內膜損傷或粘連綜合徵，子宮內膜炎，子宮發育不全或缺如，子宮切除後或子宮腔內放射治療後。
⑵ 卵巢性閉經：閉經的原因在卵巢，卵巢性激素水平低落，子宮內膜不發生週期性變化而致閉經，常見的疾病有：先天性卵巢發育不全或缺如，卵巢功能早衰，卵巢切除或組織被破壞，卵巢腫瘤。
⑶ 垂體性閉經：主要病變在垂體。垂體前葉的器質性疾病或功能失調，可影響促性腺激素的分泌，從而影響卵巢導致閉經。
⑷ 丘腦下閉經：是最常見的一類閉經。由於丘腦下功能失調而影響垂體，進而影響卵巢而引起閉經。其病因複雜，可由於中樞神經器質性病變、精神因素、全身性疾病、藥物和其他分泌功能紊亂而引起。
