要確診百日咳，首先要看是否有流行病學史和臨牀症狀，如曾經與百日咳患兒接觸，出現了陣發性、痙攣性咳嗽時，就可以對疾病做出初步的判斷；還可根據血象檢查、細菌培養、熒光抗體染色法、酶聯免疫吸附試驗等檢查結果，做出明確診斷。
百日咳是一種由百日咳桿菌感染引起的疾病，具有一定的傳染性。雖然現在的嬰幼兒都會接種百白破疫苗，但是因爲百白破疫苗效價不足，即使接種了疫苗也可能會發病。出現這種疾病時常會有咳嗽症狀，但不是所有的咳嗽症狀都是百日咳引起的，需要鑑別。那麼，百日咳怎麼確診呢？
一、根據流行病學史診斷
因爲這種疾病有一定的傳染性，所以在出現咳嗽後，要追溯咳嗽之前1~2周內有沒有和百日咳患兒接觸，如果有接觸，就表明有流行病學史，此時出現百日咳的可能性很大。
二、根據臨牀症狀診斷
出現百日咳後，常會有陣發性、痙攣性的咳嗽。不過在發病初期咳嗽症狀較輕，隨着病情的加重，咳嗽會逐漸的加重，尤其是在夜間咳嗽的更爲嚴重一些；大概患病一週後會出現陣發性、痙攣性的咳嗽，還伴隨有吸氣性的吼聲，咳嗽的持續時間比較長，可能會有兩三個月，這種咳嗽反覆發作，出現百日咳的可能性很大。
三、根據檢查結果診斷
1.血象檢查
患兒咳嗽後可以抽血化驗，如果發現白細胞明顯增多，淋巴細胞也高達0.5~0.7以上，結合着臨牀症狀判斷，基本上就可以確診患有百日咳。
2.細菌培養
從患兒的鼻咽部分泌物中提取標本進行細菌培養，如果細菌培養後的檢測結果呈陽性，結合臨牀症狀判斷，就可以確診出現了百日咳。
3.熒光抗體染色法
懷疑出現百日咳時，還可以從患兒的鼻咽部分泌物中提取標本，製成鼻咽拭子塗片，塗片乾燥後再進行熒光抗體染色檢查，如果呈陽性，就表明出現了百日咳。
4.酶聯免疫吸附試驗
利用酶聯免疫吸附試驗，可以在百日咳發病早期就做出明確的判斷；病情緩解後再進行這樣的檢查，兩次檢查結果相比，可以作爲回顧性的診斷。
