胸腺瘤一般沒有後遺症問題，但是未及時治療，可能會伴有重症肌無力、免疫缺陷、紅細胞再生障礙性貧血等。
1、重症肌無力
將近有30%~47%左右胸腺瘤患者會伴有重症肌無力等症狀，在患病期間要密切關注。
2、免疫缺陷
有些胸腺瘤類型，如果未及時治療會累及其他器官免疫功能出現問題，誘發多器官自身免疫綜合徵、神經系統副腫瘤綜合徵。
3、純紅細胞再生障礙性貧血
有5%~17%左右胸腺瘤患者會伴有純紅細胞再生障礙性貧血，尤其是年齡較大的女性患者更易發病。不過相關數據表明，胸腺切除術後緩解率可以達到40%以上，預後較好。因此，確定胸腺瘤後採取手術治療很有必要。
