百日咳桿菌有很強傳染性；治療不及時會引發多種併發症，如支氣管肺炎、肺不張、肺氣腫、重症肺炎、癲癇、百日咳腦病、腦水腫、腦癱等，嚴重時危及生命。
一、具有傳染性
百日咳桿菌有很強傳染性，若患病期間沒有隔離治療，可能傳染他人。
二、引起多種併發症
1.呼吸系統併發症
百日咳病程較長，常持續兩三個月，若沒有規範治療，可能引發多種併發症。呼吸系統併發症較常見，反覆咳嗽可能引發支氣管肺炎；痰液排除不淨，引發肺不張、肺氣腫、重症肺炎等。
2.神經系統併發症
百日咳是百日咳桿菌引發，患病後體內產生大量毒素，影響中樞神經系統，出現癲癇、智力減退、抽搐、意識障礙等，嚴重時引發百日咳腦病、腦水腫、腦癱等。
三、危及生命
百日咳常引發多種併發症，有些併發症非常嚴重，如肺不張、肺氣腫、腦出血、百日咳腦病等，有致命風險。
