治療肛瘻的用藥主要有以下幾類：第一類，抗生素類，因爲在肛瘻發作時會引起瘻管內的炎性反應，形成感染、膿腫，所以說抗生素治療非常有必要，一般選擇頭孢克肟，頭孢他啶，頭孢地尼，甲硝唑，奧硝唑，替硝唑等。第二類，軟化大便的藥物，臨牀上用的比較多的是乳果糖口服溶液，舒泰清，麻仁丸，因爲大便乾結，排便困難，很容易引起肛瘻的發作。第三類，止瀉藥，患者在明顯腹瀉的情況下也會引起肛瘻的發生，一般的藥物可以用蒙脫石散，黃連素等等。第四類，治療肛周瘙癢的藥物，因爲肛瘻的主要症狀就是外口的紅腫、疼痛、破潰、流膿，有時候會引起明顯的肛周瘙癢。臨牀上一般對症處理，應用尤卓爾或者派瑞鬆。以上方案僅供參考，具體藥品使用請結合自身情況在專業醫生指導下用藥。
