乙型肝炎病毒(HBV)爲專一的嗜肝病毒，近年由於核酸分子雜交技術的進展，在肝外器官細胞也能檢出HBV-DNA。通過北京鴨乙肝肝病毒試驗研究提供了在肝外細胞複製的證據。人HBV也可能在肝外細胞內複製，有待深入研究。
乙型肝炎病毒感染者血清經電鏡檢查有3種病毒顆粒：①Dane顆粒(HBV顆粒)，外殼蛋白HBsAg，核心含有HBV-DNA及HBVDNAp(DNA-多聚酶)、HBcAg、HBeAg;②小球形顆粒;③管形顆粒。後二者爲HBV複製過程中過剩的病毒外(HBsAg)，不含核酸。
乙型肝炎病毒基因組(HBV-DNA)由雙鏈不完全環形結構的DNA組成，含3200個核苷酸。由於其宿主範圍較小，體外細胞培養分離病毒尚未成功。近年隨着分子克隆技術的應用及體外培養細胞系轉染的成功，對HBV複製過程有了進一步的瞭解。
乙型肝炎病毒-DNA分爲負鏈(長鏈)及正鏈(短鏈)所組成。其負鏈有4個開放讀碼框架(Open Reading Frame，ORF)：①S基因區，由S基因，前S2(pre-S2)基因、前S1(pre-S1)基因組成。分別編碼HBsAg，pre-S、pre-S1及多聚人血清白蛋白受體(PHSA-R);②C基因區，由前C基因和C基因組成。分別編碼HBeAg及HBcAg;③P基因區，編碼HBV-DNAp，並具有逆轉錄酶活性;④X基因區，編碼HBxAg，並具有激活HBcAg基因的作用。
乙型肝炎病毒標誌出現的順序爲:HBsAg、HBeAg、抗-HBc-(抗-HBcIgM、抗-HBcIgG)、抗-HBe、抗-HBs，同時檢測以上各項可說明乙型肝炎病毒感染所處的階段。
