治療慢性咽炎需要先找出病因，針對病因治療，積極治療鼻炎、氣管支氣管炎等呼吸道慢性炎症及其他全身性疾病，也可局部治療，根據病情選擇適當的治療方案，必要時全身用藥。此外，還要避免長期處於高危險的環境，加強鍛鍊增強免疫力。
一、病因治療
1、戒除煙、酒。
2、改善工作和生活環境（避免粉塵及有害氣體）。
3、積極治療鼻和鼻咽部慢性炎症。
4、有胃食管反流者服用抑酸製劑。
5、糾正便祕和消化不良、治療全身性疾病，以増強抵抗力。
二、藥物治療
1、慢性單純性咽炎：常用複方硼砂溶液、呋喃西林溶液、複方氯己定含漱液等含漱。含漱時頭後仰、張口發“啊”聲，使含漱液能清潔咽後壁。亦可含服碘喉片、薄荷喉片及中成藥含片。
2、慢性肥厚性咽炎：除上述治療外，可用激光、低溫等離子等治療，若淋巴濾泡增生廣泛，治療宜分次進行。亦可用藥物（硝酸銀）、冷凍或電凝固法治療，但治療範圍不宜過廣。
3、萎縮性咽炎：用2%碘甘油塗抹咽部，可改善局部血液循環，促進腺體分泌。服用維生素A、維生素B2、維生素C、維生素E，可促進黏膜上皮生長。
三、手術治療
慢性咽炎一般無需手術治療。
四、中醫治療
