嬰兒腹瀉危害是非常大的，有可能產生各種感染情況，也可能會引起維生素缺乏和營養不良，還可能會引起中毒性肝炎。
一、感染
嬰兒長期出現腹瀉的情況沒有得到處理或沒有得到正規治療，就易引起各種感染產生，主要因爲全身抵抗力下降，比如有可能會引起中耳炎，有可能會引起上呼吸道感染，有可能會引起泌尿系統感染，也有可能會引起肺炎。
二、營養不良
長期出現腹瀉，一般就會在飲食上多加限制，而很多食物還沒有經過腸道系統消化和吸收，就已經排出體外，就易導致維生素缺乏和營養不良。
三、中毒性肝炎
嬰兒長期出現腹瀉可能會引起黃疸，常見於營養不良或敗血症患者，預後效果一般並不是很好，所以應要格外警惕中毒性肝炎的產生。
