淡鹽水清腸容易引起腸胃混亂，從而降低腸胃功能，時間久了還會影響腸胃正常蠕動，影響腸胃正常消化。若清腸時不注意相關事項，還容易造成低鈣血癥、引起身體水腫等。
淡鹽水清腸也是很常見的清腸方式，主要是通過飲用淡鹽水來達到排毒目的；該項方法常用於治療便祕以及胃部上火，但長期清腸，或者搭配比例不正常，就會適得其反，還會引起一系列併發症。那麼淡鹽水清腸的危害到底有哪些呢？
1、造成腸胃作用會混亂
用淡鹽水清腸容易造成腸胃功能混亂，腸胃功能下降後會影響正常進食，飯後經常消化不良，甚至會引起胃腸脹氣。吃了東西後再進行淡鹽水清腸，也無法徹底阻攔腸道對脂肪的吸收，雖可輔助排便，但長期飲用淡鹽水反而會給腸胃增加負擔，有胃病時進行淡鹽水清腸還會引起急性胃痛。
2、造成低鈣血癥
淡鹽水清腸容易造成低鈣血癥，因爲部分人對淡鹽水吸收好，所以進行清腸後身體代謝會加快，從而導致體重下降，也會導致鈣大量流失。進行淡鹽水清腸後水、電解質均會造毀壞，引起腹瀉，營養也會大量消耗。
3、造成水腫
長期用鹽水清腸會造成水腫，比如眼瞼浮腫、下肢浮腫等，甚至會引起手指浮腫。主要是因爲部分人的腸胃吸收力很強，把鹽水都給消化吸收了，而過多的攝入鹽會改變血漿滲透壓，從容造成自身浮腫。長期進行淡鹽水清腸還會導致血壓增高，影響鈉鹽的正常代謝，也會給腎臟增加負擔。
