過敏性肺炎是一種複雜的臨牀綜合徵，典型表現爲雙側氣道和肺實質炎症及纖維化病變。過敏性肺炎的診斷是基於過敏原暴露史、臨牀症狀、實驗室影像學檢查結果和病理學發現所共同得到的，目前尚缺乏有效的診斷標準。因此，過敏性肺炎的診斷對於臨牀醫生是一個挑戰。
1. 過敏原檢測
明確致病過敏原對於過敏性肺炎的診斷、治療及預後都非常重要。使用所有可能的檢測手段明確暴露源。首先應詳細瞭解患者的暴露史(家中或其他場所)。評估醫生應有必要的專業知識來發現所有可能的致敏原來源。其次，通過實驗室檢查明確可疑過敏原;使用沉澱反應作爲篩查工具發現致病抗原，發現特異性免疫球蛋白 G(IgG)抗體。到存在潛在抗原的環境中進行暴露試驗或對吸入抗原或其混合物(比如：從工作場所採集的灰塵或液體中淨化和稀釋的衍生物)直接進行暴露試驗。
2. 影像學
急性過敏性肺炎可表現爲雙肺結節影和磨玻璃樣改變。慢性過敏性肺炎可有網狀和蜂窩狀改變。HRCT 分辨率更高，更容易發現典型病變。過敏性肺炎在 HRCT 上可表現爲磨玻璃影、小葉中心性結節、氣體陷閉徵、纖維化、肺氣腫等改變。根據預後不同，過敏性肺炎可以分爲兩種影像學亞型：纖維化過敏性肺炎和非纖維化過敏性肺炎。
3. 肺功能檢查
急性過敏性肺炎患者 PFT 可以是正常的。有時也可表現爲限制性通氣功能障礙，一氧化碳彌散能力下降。農民患者肺的 PFT 可出現阻塞性通氣功能障礙，導致肺氣腫形成。PFT 可用於診斷和隨訪過程中判斷肺功能受損的嚴重程度。
4. 支氣管肺泡灌洗液(BAL)
雖然並不常規推薦 BAL 用於 IPF 的診斷;但是對於疑似過敏性肺炎患者，BAL 可用於評估患者肺部炎症情況，且敏感度較高。對於急性過敏性肺炎，BAL 中細胞總數和淋巴細胞百分比增高。對於慢性過敏性肺炎，BAL 中淋巴細胞計數水平較低或正常。
5. 組織病理學
當未發現暴露抗原和/或影像學表現不典型時，需要通過組織病理學評估進行明確診斷。不是所有的患者能夠或願意接受外科活檢，這會導致診斷不確定性的產生。對於急性過敏性肺炎，典型組織病理學改變包括：淋巴性肺泡炎支氣管中心性加重，非壞死性上皮細胞肉芽腫，肺泡纖維化和毛細支氣管炎。相反，慢性過敏性肺炎 的形態學特徵並不特異：UIP 樣表現，支氣管周圍伴NSIP樣表現，輕度肺泡炎/支氣管炎和限制性肉芽腫形成。
過敏性肺炎，特別是慢性過敏性肺炎的診斷是困難的，往往會導致漏診的發生。診斷中最關鍵的一點是：有相關抗原暴露史。病史中明確抗原暴露和症狀起病的相關性對於診斷是有幫助的。血清IgG/沉澱素可幫助明確抗原，有時也可考慮行抗原激惹試驗。
