兒童咳嗽並沒有最有效的方法，應根據咳嗽的原因採取相應的治療方法。吸入異物所致，如果不能咳出，要採取海姆立克急救法，嚴重時則要去醫院取出；過敏所致需應用抗組胺藥、支氣管擴張劑和白三烯類拮抗劑進行治療；支原體感染所致，可應用大環內酯類抗生素及止咳化痰類藥物治療。
兒童咳嗽可能是因爲吸入了異物，刺激呼吸道引起的。通過咳嗽可以將異物咳出，如果不能咳出，並出現了呼吸困難的症狀，應採取海姆立克急救法，避免發生窒息。若仍然不能將異物排出，則要及時就醫，利用纖維支氣管鏡將異物取出。
兒童頻繁咳嗽，且夜間表現比較明顯，考慮與過敏性因素有關。需要查找過敏原，並儘量避開，減少過敏原的刺激之後，咳嗽症狀也會減輕。此外還要應用抗組胺類藥物、支氣管擴張劑以及白三烯拮抗劑等藥物進行治療，如氯雷他定片、氨茶鹼片、孟魯司特鈉咀嚼片等。
若兒童受到支原體感染，引起支原體支氣管炎或者支原體肺炎，也會導致咳嗽。可以應用大環內酯類抗生素、止咳化痰類藥物進行治療，常用的是阿奇黴素幹混懸劑、肺力咳合劑、氨溴特羅口服溶液等。
