腦部進行伽馬刀手術時操作不當，可能出現顱內壓升高、癲癇發作、腦神經功能障礙、面癱等副作用。
1.顱內壓增高：在進行腦部伽馬刀手術時，會因輻射影響使腦部毛細血管破裂、腦組織水腫，術後護理不當大腦產生炎症反應可能會引起腦膜炎。受到上述因素的影響，腦內有異常物質滲出，可能使顱內壓增高，患者有頭痛、噴射狀嘔吐、食物模糊等表現，嚴重時會昏迷、嗜睡等。
2.癲癇發作：通過伽馬刀照射大腦半球，可能會對局部組織造成灼傷，引起組織瘢痕化，有可能使腦神經元異常放電，導致癲癇發作。
3.腦神經功能障礙；在進行伽馬刀手術過程中，還可能對大腦神經元造成傷害，使腦神經功能異常，患者可能在術後出現語言障礙、思維運動遲緩等表現。
4.面癱：患聽神經瘤，進行伽馬刀手術時，可能會損傷面部神經，出現面癱，有嘴歪眼斜、面部麻木、味覺喪失等表現。
