實際上，中藥並不是全是肯定安全性的。很多中藥含有的各種各樣黃酮及成分亦十分複雜，尤其是各味中藥互相搭配之後其造成的功效差別很大，有的可立即或間接性危害到胎兒的成長髮育。因而在孕期的最開始三個月內，孕婦除慎用藥物外，亦應慎用一部分中藥，以防導致畸胎或造成早產、小產。
大毒熱門藥物。如生南星、硃砂、雄黃、大戟、祿特科技、商陸、斑蝥、大蜈蚣、砒石等，自身便是具備一定毒副作用的藥物。中藥雄黃已毫無疑問生姿畸胎功效，孕婦應肯定嚴禁口服，硃砂帶有可滲性汞鹽(即液態水銀)，可在孕婦身體堆積，造成新生嬰兒小頭畸形、失聰、眼睛斜視、智力障礙等。
活血化瘀藥物。如杏仁、紅花、枳殼、蒲黃、益母草顆粒、川芎、三棱、水蛭、虻蟲、中藥穿山甲、乳香、制沒藥等，可使孕婦血液循環系統加速，具備刺激性孑宮，反射造成孑宮明顯收攏的功效，造成胎兒宮腔內缺血性氧氣不足，使胎兒發育不全及造成各種各樣畸型，乃至造成小產、早產和胎死腹中。
滑利佔領藥物。如長石、木通、牽牛子、冬葵子、薏米仁(根)、巴豆、芫花、大戟、甘遂等，多有換氣有利排尿下瀉的功效，可根據刺激性腸胃及消化道，激動孑宮並造成反射的收攏，使胎兒受精卵着牀不穩定而造成小產、早產。
芬芳走竄藥物。如丁香花、沉香、血竭等，可根據中樞神經系統造成宮縮，也非常容易造成胎兒早產或小產。許多人流手術或引產手術藥物中，血竭均爲在其中的主要成分之一。
還應勸誡孕婦的是，有很多具備副作用的中草藥材，常以祕方方式發生在中藥方劑當中，因此對帶有以上各種的中藥務必慎用。對已標明有孕婦禁止使用或慎用的中藥方劑，應防止服食，或挑選作用類似而沒什麼副作用的藥物代之。
當然，在豐富多彩的中藥寶藏中，對孕婦有欠佳功效的藥物終究是極少數，中藥做爲純天然藥物依然比藥物的不良反應要小得多。因此，孕婦在生病時無須諱病忌醫，應立即看醫生醫治，請醫師及時止損挑選應用中藥。
