輸卵管妊娠發生之後，這種異常妊娠最終流產是其結果之一。輸卵管妊娠造成輸卵管破裂相比，輸卵管流產對女性造成的危害小，也不出現輸卵管破裂所產生的症狀那麼嚴重。
輸在8到12周時輸卵管妊娠是最容易流產的。在輸卵管內輸卵管粘膜皺襞，是受精卵所種植的位置。隨着胚胎的發育能配會將包膜突破並引起出血。這種情況下能配就會從皺壁剝離，進入管腔。輸卵管受到刺激後，會產生例如動的現象，再由傘端將胚胎排出腹腔，這樣就造成了輸卵管妊娠流產。
輸卵管妊娠流產會有出血的症狀，但是出血不是特別嚴重，出血量不多。如果遇到到囊胚沒有完整剝離這種情況，輸卵管壁內還會殘留有胚胎殘留物，這種情況就是輸卵管妊娠流產不全，這樣就容易引起女性反覆出血，輸卵管也因此形成血腫，周圍組織同樣會受到影響。
在輸卵管妊娠流產之後，多數情況下死亡的胚胎會被機體吸收，但也有因胚胎而造成輸卵管血性胎塊的現象。
