軟下疳患者如不及時發現和治療可發生各種併發症，常見的有下列幾種：
1、軟下疳性淋巴結炎
又稱軟下疳性橫痃或痛性橫痃，50-60%患者可以發生，多在軟下疳潰瘍出現後數天到了周內發生。以腹股溝多見，常爲單側性，開始爲局部淋巴結腫大，有輕微壓痛，然後可逐步累及鄰近多個淋巴結，併產生淋巴結周圍炎，彼此可融合成較大的團塊。局部皮膚可紅腫，觸之有波動感，最後可破潰而形成潰瘍。此時患者可有明顯的疼痛，還可伴有發燒，常需2-4周才逐步癒合形成疤痕。
2、包皮炎和嵌頓包莖
當患者在包皮內發生軟下疳時，可因炎症水腫而造成包皮炎性包莖，包皮內膿汁積瀦可引起龜頭炎。如果包皮高度水腫不能翻轉時則可引起嵌頓包莖。
3、尿道瘻
由於陰莖部軟下疳可造成陰莖毀壞性潰瘍而侵犯及尿道，可引起排尿劇痛，最後可導致尿道狹窄，排尿困難。
在感染軟下疳的同時少數病人還可繼發感染梅毒和性病性淋巴肉芽腫等，可以增加損害的嚴重性，此時可發生混合性下疳，往往難以治療。
4、繼發感染
